Als homolog bezeichne ich Körper oder Körperteile, die sich auf einen gemeinsamen Bauplan zurückführen lassen. Ihre unterschiedliche Ausprägung wird durch Divergenz erklärt. Ein Beispiel: Die Flosse eines Delfins und das Grabbein eines Maulwurfs sind bezüglich des Armskelettes homolog, da die Reihenfolge der Knochen, also Oberarmknochen, Elle und Speiche, Handwurzelknochen, Mittelhandknochen und Fingerknochen, gleich geblieben ist. Kurz: Gleicher Bauplan aber andere Funktion.

Analog sind in diesem Sinn Strukturen, deren Ähnlichkeiten nicht auf einem gemeinsamen Bauplan beruhen, sondern durch ähnliche Umweltbedingungen entstanden sind, d. h. die ähnlichen Merkmalsausprägungen werden durch Konvergenz erklärt. Ein Beispiel: Die Flügel der Vögel und die Flügel der Fledermäuse sind bezüglich der Tragfläche – Federn bzw. Flughaut – zueinander analog, denn die beiden Flügelkonstruktionen sind nicht aus einem gemeinsamen fliegenden Vorfahren hervorgegangen, sondern unabhängig voneinander zweimal entstanden. Allerdings sind sie vom Skelettaufbau her sehr wohl homolog als Tetrapodenvorderextremitäten.

Analoge Strukturen oder Verhaltensweisen erfüllen in den einzelnen Organismen den gleichen Zweck, sind also bezüglich ihrer Funktion äquivalent, jedoch nicht auf gemeinsame Vorfahren zurückzuführen. Sie beruhen daher auch nicht auf gemeinsamen Erbanlagen und sind nicht geeignet, eine engere verwandtschaftliche Beziehung zu begründen. Vereinfacht ausgedrückt beruhen homologe Merkmale auf gemeinsamen Vorfahren, analoge Merkmale auf gemeinsamer Umwelt und einem Selektionsdruck, der in die gleiche Richtung wirkt.